恩納村では漁協が主体となってオニヒトデ駆除を実施しています。かけがえのない美しい海のサンゴを守ることを目標とし、オニヒトデの大発生を未然に防ぐことを目的として、恩納村、リゾートホテル、漁協が連携し、効率的なオニヒトデ対策に取り組んでいます。駆除したオニヒトデの数やサイズ、場所を記録したデータは、オニヒトデ大量発生の予測に役立てられています。

過去のオニヒトデ対策ではその具体的な対策について各地で話し合う場が設けられていました。特に、オニヒトデ駆除については地元行政と漁協、ダイビング事業者などの関係者が「守るべき」、「守れる」、「守りたい」場所を協議して決められていました。オニヒトデが少なくなっている現在では、その様な話し合いの場は少なくなっていますが、宮古島の美ら海連絡協議や八重山の石西礁湖自然再生協議会などのように、サンゴ礁の利用や保全について話し合う場が地域で立ち上がっています。オニヒトデ大量発生が予測された場合は、その様な既存の組織と情報を共有したり連携したりすると効率的です。また、既存の協議会等がない地域に関しては、各ダイビング事業者や漁業者と情報を共有してオニヒトデ大量発生に備えていくことが必要となってきます。石垣市ではサンゴ保全庁内連携チームが結成され、横断的な施策の提案や実施が図られており、同様な行政組織の連携が望まれています。